Zo voelt het leven als je EB hebt
Versla de bacterie: onderzoek in Groningen
Nieuwste technologie
In het verleden was Jan Maarten voor zijn onderzoek aangewezen op ‘tweede generatie’ bacteriën, afkomstig van een monster uit de wond en opgekweekt in een reageerbuis.
Tegenwoordig is het mogelijk om, dankzij de nieuwste technologie voor DNA- en RNA analyse, de oorspronkelijke bacterie in de wond zelf te bestuderen. Zo kunnen de onderzoekers een veel beter beeld krijgen van de werkelijke genetische samenstelling en van de context.
Met deze kennis is het misschien mogelijk de bacteriën definitief te verslaan. Daarmee zijn niet alleen alle EB-patiënten geholpen. De resultaten van het onderzoek zijn ook zeer waardevol voor de behandeling van andere huidwonden, zoals brandwonden.
Crowdfunding
Het RUG zette een crowdfundingsactie op met een streefbedrag van € 15.000. Debra Belgium doneerde 3.000 EUR.
Met dat geld kunnen vijftig samples worden geanalyseerd. Voldoende om in ieder geval de belangrijkste kenmerken van de bacteriën in kaart te brengen.
Projectupdate 19.05.2015
Update voorjaar 2015
Wat begon als een klein onderdeel van het onderzoek naar het gedrag van de S. Aureus bacterie in de chronische wonden van Epidermolysis Bullosa patiënten, heeft geleid tot een vliegwiel effect. In het najaar van 2013 stelde een goede doelen stichting een bedrag van € 75.000 ter beschikking, onder voorwaarde dat er aanvullende financiering gezocht zou worden voor dit onderzoek. Onlangs heeft de Graduate School of Medical Sciences van het UMCG zich voor drie jaar garant gesteld voor de kosten van een onderzoeker. Dat betekent dat dit onderzoeksproject volledig kan worden uitgevoerd!
Pilots
Inmiddels zijn verschillende pilot-experimenten uitgevoerd met bacteriën die uit het verband van EB-patiënten geïsoleerd werden. Vervolgens zijn de genexpressie- en eiwitprofielen van deze bacteriën geanalyseerd met behulp van RNA-sequencing en massaspectrometrie (MS).
De data die tot dusver zijn verkregen zijn van zeer goede kwaliteit. Op dit moment worden ze geanalyseerd om de verschillende bacteriën die de wonden van EB-patiënten koloniseren in detail te karakteriseren en te bepalen hoe deze bacteriën op elkaar reageren.
Bacteriën geïsoleerd
In de tweede plaats is onderzocht hoe bacteriën het beste uit wonden geïsoleerd kunnen worden voor directe analyse van gen- en eiwitexpressie. Hoewel het nog niet goed gelukt is om RNA van voldoende goede kwaliteit voor RNA-sequencing te verkrijgen, lijkt het al wel goed mogelijk om eiwitten van de geïsoleerde bacteriën via MS te analyseren.
In maart 2015 werd een bijeenkomst voor grote donateurs aan dit project georganiseerd. Deze bijeenkomst werd gehouden in het UMCG op de afdeling Medische Microbiologie, waar het onderzoek wordt uitgevoerd, en het Centrum voor Blaarziekten, waar de patiënten met EB behandeld worden.
Meer info op www.rugsteunt.nl
